寻找失踪的佐助是主线剧情的重要任务之一。玩家需要通过完成一系列任务和挑战来推进剧情，最终找到佐助。游戏中的方法包括追踪线索、战斗解谜、团队协作和剧情互动。这些环节的设计让玩家能够深入体验火影忍者的世界观和角色关系。
游戏会提供一系列任务提示，比如与NPC对话获取情报，或者调查特定地点寻找佐助的踪迹。玩家需要仔细分析这些线索，逐步缩小搜索范围。有些任务还需要解开谜题或完成小游戏，比如破解密码或寻找隐藏物品。这些设计增加了游戏的趣味性和挑战性。
在寻找佐助的过程中，玩家会遇到各种敌人和障碍，需要通过战斗或策略来解决。某些关卡需要击败守卫才能继续前进，或者利用角色的特殊能力绕过障碍。战斗系统通常采用回合制或即时动作模式，玩家可以根据自己的喜好选择策略。
玩家可以组建自己的忍者小队，利用不同角色的技能互补来完成任务。鸣人的影分身可以吸引敌人注意力，而卡卡西的写轮眼能看破幻术。这种设计不仅增强了游戏的策略性，也让玩家更深入地体验角色之间的羁绊。
游戏会通过过场动画和对话揭示佐助失踪的原因和去向。玩家需要积极参与这些互动，比如做出对话选择或触发特定事件。这些互动不仅丰富了剧情，也让玩家更投入角色和故事。
